MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 66194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013192	T	6	6	23	28	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013192	TAT	2	6	33	38	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013192	TAGTG	2	10	55	64	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013192	TAG	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013192	TAA	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013192	ATT	2	6	185	190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013192	TA	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013192	TAATA	2	10	253	262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013192	TA	3	6	261	266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013192	TTA	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013192	TA	4	8	271	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013192	TTA	3	9	279	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013192	ATAA	2	8	314	321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013192	T	6	6	375	380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013192	CAA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013192	ATAA	2	8	515	522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013192	ATT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013192	TATTT	2	10	591	600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013192	A	7	7	636	642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013192	T	6	6	643	648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013192	AATG	2	8	686	693	50 %	25 %	25 %	0 %	257124815
22	NC_013192	A	6	6	709	714	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
23	NC_013192	AGA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
24	NC_013192	A	7	7	729	735	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
25	NC_013192	T	6	6	762	767	0 %	100 %	0 %	0 %	257124815
26	NC_013192	ATA	2	6	796	801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
27	NC_013192	ACA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257124815
28	NC_013192	GAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
29	NC_013192	ATA	2	6	897	902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
30	NC_013192	A	7	7	920	926	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
31	NC_013192	AT	3	6	996	1001	50 %	50 %	0 %	0 %	257124815
32	NC_013192	TTG	2	6	1039	1044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124815
33	NC_013192	TTTA	2	8	1119	1126	25 %	75 %	0 %	0 %	257124815
34	NC_013192	GAAAT	2	10	1171	1180	60 %	20 %	20 %	0 %	257124815
35	NC_013192	AAT	2	6	1188	1193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
36	NC_013192	TAT	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124815
37	NC_013192	GAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
38	NC_013192	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124815
39	NC_013192	GGAA	2	8	1355	1362	50 %	0 %	50 %	0 %	257124815
40	NC_013192	GGA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124815
41	NC_013192	CA	3	6	1383	1388	50 %	0 %	0 %	50 %	257124815
42	NC_013192	ATA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124815
43	NC_013192	TC	3	6	1460	1465	0 %	50 %	0 %	50 %	257124815
44	NC_013192	T	6	6	1484	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	257124815
45	NC_013192	ATG	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124815
46	NC_013192	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
47	NC_013192	GAC	2	6	1581	1586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257124815
48	NC_013192	AT	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	257124815
49	NC_013192	A	6	6	1684	1689	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
50	NC_013192	AGTT	2	8	1699	1706	25 %	50 %	25 %	0 %	257124815
51	NC_013192	A	7	7	1757	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
52	NC_013192	GATAT	2	10	1806	1815	40 %	40 %	20 %	0 %	257124815
53	NC_013192	A	6	6	1830	1835	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
54	NC_013192	GTT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124815
55	NC_013192	TATT	2	8	1863	1870	25 %	75 %	0 %	0 %	257124815
56	NC_013192	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
57	NC_013192	ATG	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124815
58	NC_013192	CGG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257124815
59	NC_013192	A	9	9	1969	1977	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
60	NC_013192	AAG	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124815
61	NC_013192	A	7	7	2022	2028	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
62	NC_013192	A	7	7	2041	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	257124815
63	NC_013192	TAT	3	9	2048	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013192	A	6	6	2060	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013192	CAT	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013192	A	6	6	2080	2085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013192	TA	3	6	2087	2092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013192	TGA	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013192	A	7	7	2194	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013192	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013192	AAT	2	6	2211	2216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013192	ATT	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013192	ATAA	2	8	2245	2252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013192	T	8	8	2283	2290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013192	TA	3	6	2297	2302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013192	A	6	6	2302	2307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013192	TTG	2	6	2321	2326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013192	A	7	7	2327	2333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013192	TA	3	6	2334	2339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013192	ATA	2	6	2351	2356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013192	ATA	2	6	2374	2379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013192	A	8	8	2419	2426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013192	ATA	2	6	2474	2479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013192	TAA	2	6	2492	2497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013192	A	6	6	2502	2507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013192	A	6	6	2530	2535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013192	CAATG	2	10	2544	2553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013192	A	7	7	2635	2641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013192	A	6	6	2704	2709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013192	GAT	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013192	AAAAT	2	10	2736	2745	80 %	20 %	0 %	0 %	257124816
92	NC_013192	GAA	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124816
93	NC_013192	GTG	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257124816
94	NC_013192	AAGTAA	2	12	2853	2864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257124816
95	NC_013192	A	7	7	2891	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	257124816
96	NC_013192	ATG	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124816
97	NC_013192	TGT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124816
98	NC_013192	A	6	6	3035	3040	100 %	0 %	0 %	0 %	257124817
99	NC_013192	AGA	2	6	3058	3063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
100	NC_013192	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124817
101	NC_013192	TTA	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
102	NC_013192	ACAAA	2	10	3102	3111	80 %	0 %	0 %	20 %	257124817
103	NC_013192	AGA	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
104	NC_013192	T	7	7	3208	3214	0 %	100 %	0 %	0 %	257124817
105	NC_013192	AGA	2	6	3229	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
106	NC_013192	AT	3	6	3277	3282	50 %	50 %	0 %	0 %	257124817
107	NC_013192	GGA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257124817
108	NC_013192	CTG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257124817
109	NC_013192	TCT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124817
110	NC_013192	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
111	NC_013192	AAG	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
112	NC_013192	A	6	6	3484	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	257124817
113	NC_013192	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
114	NC_013192	A	6	6	3530	3535	100 %	0 %	0 %	0 %	257124817
115	NC_013192	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
116	NC_013192	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
117	NC_013192	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257124817
118	NC_013192	TAT	2	6	3596	3601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
119	NC_013192	T	6	6	3617	3622	0 %	100 %	0 %	0 %	257124817
120	NC_013192	TTA	2	6	3696	3701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
121	NC_013192	AAT	2	6	3725	3730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124817
122	NC_013192	T	6	6	3770	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	257124817
123	NC_013192	GAA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
124	NC_013192	ATG	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
125	NC_013192	TA	3	6	3885	3890	50 %	50 %	0 %	0 %	257124817
126	NC_013192	A	7	7	3923	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	257124817
127	NC_013192	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
128	NC_013192	CTT	2	6	4106	4111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257124817
129	NC_013192	A	6	6	4140	4145	100 %	0 %	0 %	0 %	257124817
130	NC_013192	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	257124817
131	NC_013192	A	6	6	4214	4219	100 %	0 %	0 %	0 %	257124817
132	NC_013192	TTA	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
133	NC_013192	CAA	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257124817
134	NC_013192	ATG	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
135	NC_013192	ATT	2	6	4407	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257124817
136	NC_013192	GAA	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
137	NC_013192	ATG	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124817
138	NC_013192	GTT	2	6	4508	4513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124817
139	NC_013192	AGA	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257124817
140	NC_013192	TTG	2	6	4620	4625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124817
141	NC_013192	GAA	2	6	4685	4690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013192	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257124818
143	NC_013192	GAAGTT	2	12	4747	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257124818
144	NC_013192	AT	3	6	4778	4783	50 %	50 %	0 %	0 %	257124818
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282	NC_013192	TAA	2	6	10215	10220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013192	TAT	2	6	10242	10247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013192	TAT	3	9	10261	10269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013192	AATTA	2	10	10270	10279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013192	T	7	7	10292	10298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013192	T	6	6	10322	10327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013192	A	7	7	10402	10408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013192	A	6	6	10465	10470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013192	A	7	7	10490	10496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013192	TAA	2	6	10504	10509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_013192	T	6	6	10571	10576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013192	ATT	2	6	10583	10588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_013192	A	7	7	10602	10608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_013192	TTG	3	9	10657	10665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257124823
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